Координаціна діяльність Міжнародного Центру реалізується у його співпраці з провідними науковими установами НАН України та МОН України. В першу чергу, співпраця здійснюється з Верховною Радою України, Кабінетом Міністрів України, Міністерством економіки, Міністерством закордонних справ, Міністерством внутрішніх справ, Міністерством охорони здоров'я.
Багатогранна координаційна діяльність здійснюється в рамках функціонування фізико-математичної школи «Жукіно».
В рамках міжнародної координаційної діяльності на державному рівні директор Центру професор В.І. Гриценко виконує функції члена Національної комісії України у справах ЮНЕСКО, є постійним представником України на сесіях Генеральної конференції ЮНЕСКО. У зв’язку з включенням України до складу Виконавчої ради Міжурядової Програми ЮНЕСКО «Інформація для всіх» представником України у Виконавчій раді обрано директора Центру, завідувача кафедрою ЮНЕСКО професора В.І. Гриценка. В рамках співробітництва з ЮНЕСКО проводиться координаційна робота зі структурами Виконавчої Ради ЮНЕСКО, керівництвом Крупних програм, представниками Національних комісій по обговоренню стратегічних орієнтирів діяльності ЮНЕСКО, у тому числі, стратегічних напрямків розвитку інформаційних технологій та систем.